ผลข้างเคียงหลัก ของยาฝังคุมกำเนิด คือ ประจำเดือนผิดปกติค่ะ บางคนมีเลือดออกกระปริบกระปรอยทางช่องคลอด บางคน ประจำเดือนไม่มา ซึ่งอาการเหล่านี้ เกิดจากฮอร์โมนในยาฝัง ทำให้เยื่อบุโพรงมดลูกฝ่อบางลง ไม่หลุดออกมาเป็นประจำเดือน อย่างไรก็ตาม เยื่อบุโพรงมดลูกที่ฝ่อบางนี้ มีความเปราะบางมาก บางครั้งก็หลุดออกมา เป็นเลือดออกกระปริบกระปรอยทางช่องคลอด เป็นเวลาหลายๆวันได้ ค่ะ ถ้ามีแค่เลือดออก แต่ไม่มีอาการอื่น เช่น ปวดท้อง ตกขาว ไข้ ร่วมด้วย อาจสังเกตไปก่อนได้ค่ะ แต่ถ้ามีอาการอื่นๆ ข้างต้น ควรไปพบแพทย์ เพื่อตรวจภายในค่ะ อาจมีสาเหตุอื่นๆ ร่วมด้วย